Su controversial gestión en el Ministerio Público llegó a su fin. El pleno de la Junta Nacional de Justicia (JNJ) destituyó a la Fiscal Suprema Titular Patricia Benavides, tras comprobar que incurrió en faltas graves durante su gestión.

Este procedimiento iniciado el 24 de enero de 2024, por el JNJ, recopiló pruebas, investigaciones y testimonios que confirmaron la participación y responsabilidad de la ex fiscal de la Nación.
Según el artículo cuarto de la resolución, la decisión fue unánime al considerar que no se acreditó responsabilidad disciplinaria en tres casos específicos: la remoción de la fiscal Aurora Remedios Fátima Castillo Fuerman, la gestión del caso Sánchez Paredes y el cese de Víctor Manuel Cubas Villanueva como secretario técnico de la Oficina Técnica de Implementación del Nuevo Código Procesal Penal.
Además, Patricia Benavides fue absuelta por mayoría en relación con los cambios realizados en la conformación del Equipo Especial que investiga el caso “Los Cuellos Blancos del Puerto”. Según la resolución, no se encontraron pruebas suficientes para determinar que dichos cambios constituyeran una falta disciplinaria.
Estas decisiones representan un giro en los casos que han mantenido a ambas figuras judiciales en el centro de la atención pública y reafirman el principio de presunción de inocencia en procesos de responsabilidad disciplinaria.